尋根書院是整個勺園的中樞神經，是一個集藝術品展示、工藝品銷售、珍稀錢幣收藏、文化教育、會務接待、商務辦公等多種功能的綜合館。書院分上下兩層，藏品豐富，種類多樣，主要類別為：根雕、玉石、瓷器、精品國畫、名人書畫、歷代經典字畫。院內設有一大一小兩間會議廳，一樓會議廳可容納五六十人開展活動。二樓會議廳具有南湖紅船文化特色，比照南湖紅船內景布置，從窗外眺望出去便可欣賞南湖美景，與煙雨樓近在咫尺。館內巧妙融合“國寶”、“國學”、“國樂”、“國畫”、“國術”元素，一區多用：將《芥子園畫譜》生動地再現在游客面前，將歷代文物精品的生動展示出來，成為現代文化消費用途的國寶高仿品的銷售平臺、中國古典文學藝術詩詞楹聯及文房四寶的展示交流交易與市場化營運、江南絲竹民樂的集成化展示交流培訓演出、中國畫與書法藝術的交流平臺展示中心，并搭建其市場化運行的平臺、文武兼備將武術的“動”與丹青的“靜”有機融合，室內文化精品成列交流洽談與室外開闊的武術戲曲等現場秀進行巧妙組合，形成文化格局上的樞密相間動靜相宜之態。 館內有嘉興市高層次聯誼會、浙江勺園拍賣有限公司、吳牧野工作室、彧卿文化傳播有限公司、嘉興菱文化工作室等。